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专业销售 德国 DECODON Delta2D蛋白质双向电泳凝胶分析软件

  • 产品型号:
  • 更新时间:2024-06-18

简要描述:德国 DECODON Delta2D蛋白质双向电泳凝胶分析软件

产品详情

德国 DECODON 公司之 Delta2D 分析软件在双向凝胶(2D 及DIGE)分析中*应用点对点图像变形技术(warping) ,通过简单步骤,使用TIGR Multiple Experiment Viewer 数学程式 (MeV, version 4.0, tm4.org/mev.html, Saeed et al. 2003) 并配合全新*智能向量技术 (SmartVectors™ Technology)更快, 更有效, 更准确进行2D凝胶图像处理

1. 有效消除不同2D凝胶间于跑胶时所产生的微少区别, 免去一系列冗长枯燥的斑点匹配和边界确定的编辑工作,并可视化比较斑点, 达致* 斑点匹配 (* Spot Matching)。

2. 配合融合图像技术(Image Fusion),把多个图像透过点对点变形合并到一个新的图像中。从而创建一个拥有所有能收集到的斑点的蛋白组图谱(proteome map) 或 把多个平行实验精简到单个平均图像来进行分析。

3. 实时网上侦察和量化分析 (GenBank , GenoList 及其它),你能更快更简单分析众多的2-D胶和DIGE胶, 并能取得更多信息。
4. 能完整及准确表达2-D 及DIGE 电泳图像, 并能进行管理和注释斑点信息, 报告和导出结果。5. 2010年发表的相关文章:Delta2D 和 Proteomweaver:两款2-DE分析工具的性能评估
主要内容如下:
Delta2D 和 Proteomweaver:两款2-DE分析工具的性能评估
 
Delta2D and Proteomweaver: Performance evaluation of  two different
approaches  for 2-DE analysis
 
Electrophoresis 2010,  31, 1311–1317
Renato Millioni1、Manuela Miuzzo2、Stefano Sbrignadello、Ellen  Murphy11,3、Lucia  Puricelli1、Andrea Tura3、Elisa  Bertacco1、Marcello Rattazzi1、Elisabetta Iori1、Paolo Tessari1
 
电泳学杂志《Electrophoresis》于2010年31卷发表了一篇Decodon公司的2-DE(2D凝胶电泳)分析软件Delta2D (D2D)与另一款同类分析软件Proteomweaver (PW)性能比较的文章,题目是:《Delta2D 和 Proteomweaver:两款2-DE分析工具的性能评估》。主要内容如下:
 
2-DE是研究蛋白质组的重要手段。然而,尽管2-DE技术能够同时高效分离多个蛋白质,但该技术的不足之处在于重复性差,特别是在比较不同实验室的实验数据时尤为明显。2-DE电泳产生差异的原因主要可分为两类:实验过程中造成的和实验后造成的。实验过程中差异的出现主要是由物理和化学参数决定的;而实验后造成差异的主要原因是使用不同的分析软件,特别是工作程序的不同。用于分析2-DE的软件很多,对凝胶图像的识别与处理方式各不相同;目前为止尚未有相关研究说明这些分析软件在2-DE分析过程中的优劣。在Electrophoresis 的这篇文章里面,意大利Padua大学的Renato Millioni等人利用Delta2D和 Proteomweaver两套软件对相同的凝胶图像(标准凝胶、实验凝胶图像)进行分析比较,结果显示:对于标准凝胶图像,比起PW来,D2D的错漏数低50%、假阳性数低77%、阳性正确率高19%,并且斑点匹配率高4%;在实验凝胶图像的比较中发现D2D要比PW节省30%的时间,并且人为参与的部分更少。
 
软件:Proteomweaver  version  3.0(Bio-Rad, CA, USA)  ,Delta2D  version  4.0  (Decodon, Greifswald,  Germany)
 
凝胶图像:
实验凝胶图像:来自Padua大学的Renato Millioni实验室实验凝胶图像,共两组(组A,组B,如图1)
图像变形:通过对软件相关参数的设置模拟凝胶在实验过程中因各种物理化学参数产生的凝胶变形。

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